章程与股东决定发生冲突时，不能简单回答“以章程为准”或“以最新决定为准”。关键要区分：股东决定是在执行章程，还是已经明确改变了章程规则；同时还要审查作出决定的主体、事项内容、文件形式以及是否需要办理变更登记或备案。

章程是公司的长期治理规则，通常规定法定代表人的产生方式、执行董事和经理的权限、对外投资或担保的内部程序，以及股东作出决定的形式。股东决定则针对某一项具体事项，例如任免人员、分配利润、对外投资或修改章程。一般而言，股东决定不能在没有明确修改章程的情况下，直接否定章程中已经确定的权限和流程。

处理冲突时，可按以下顺序核对：

1. 先看冲突性质。 如果股东决定只是落实章程，例如依照章程任命执行董事，二者并不矛盾；如果决定直接改变法定代表人的产生方式、权限分配或机构设置，就可能涉及章程修改。
2. 再看决定内容是否明确。 不能只写“同意变更”或“同意执行”，应写明原规则、新安排、执行人员，以及是否同步修改章程。
3. 确认程序和留痕。 一人有限责任公司的股东应以书面形式作出决定，由股东签名或盖章并留档。涉及章程修改的，应保留修订后的章程文本。
4. 检查外部手续。 法定代表人、注册资本、住所、经营范围等事项发生变化时，内部决定不当然等于登记或备案已经完成。

因此，若股东决定与章程不一致，较稳妥的做法不是直接选择其中一份文件，而是先判断该决定是否包含有效的章程修改，再补齐相应文件和登记手续。若冲突涉及重大投资、利润分配、法定代表人变更或潜在争议，应在执行前由专业人员审核。