股东决定书不能替代公司章程。二者都属于公司治理文件，但法律功能不同：公司章程是规范公司组织结构、股东权利义务、议事规则和经营管理安排的基础性文件；股东决定书则是唯一股东针对某一具体事项作出的书面决定，主要用于证明“谁在什么时间决定了什么”。

两者的核心区别

一人有限责任公司不设股东会，唯一股东对相关事项作出决定时，应采用书面形式，由股东签名或者盖章，并置备于公司。股东决定书适合记录变更法定代表人、调整注册资本、利润分配、对外投资、重大借款、公司解散等具体事项。

但它的效力范围通常限于所载明的决定事项，不能像公司章程一样，持续规范公司的治理规则。比如，股东决定书可以决定“修改公司章程”，却不能直接成为一份完整、长期适用的章程文本。需要变更章程内容时，通常还应形成章程修正案或修订后的章程，并根据事项需要办理登记、备案或其他外部手续。

实务中容易混淆的地方

股东决定书也不能替代法定代表人、执行董事、经理等人员依法或依章程作出的任职、执行文件；涉及银行、税务、登记机关或其他机构办理时，还要符合对方的材料要求。决定书中写明“同意变更”，不等于登记信息已经自动完成变更。

文件之间还应保持一致。公司名称、统一社会信用代码、股东名称、人员姓名、职务和日期，应与营业执照、公司章程、任职文件及申请材料相互对应。若涉及利润分配或股东资金往来，股东决定书只能证明作出过相关决定，不能替代财务核算、税务处理和付款凭证。

因此，较稳妥的做法是：用公司章程确定长期治理规则，用股东决定书记录具体重大事项；需要修改章程时，再同步形成章程修正文件，并完成相应的执行和办理程序。